但由于清廷的兵势强大，明朝自顾尚且不瑕，那还有精力去管朝鲜的事情呢？而且清廷击败朝鲜之后，也在朝鲜扶植了一批亲清派的势力，多尔衮在朝鲜的便宜老丈人李世绪也就是其中之一，因此也在朝鲜朝廷中形成了亲清、亲明的两派势力互相争权夺利，各不相让。不过随着清廷越来越强，朝鲜国内的亲清派势力也就越来越大，一直到清廷入关，明朝灭亡，亲清派势力也在朝鲜朝廷中占了絶对的优势。当然也就再没有人提什么重新回归明朝了。
但就在这时，商毅倔起，连续击败了清廷两次南侵，使中国形成了南北对持之势，这些情况朝鲜国内也都清楚，因此朝鲜的亲明势力也再次蠢蠢欲动，大有卷土重来之势。
而这时的朝鲜王李琮到是也想回归明朝，但两次败战也使他心有余悸，何况朝鲜对中国的局势也打听得十分清楚，现在南方四分五裂，一共有三个明藩建立的朝廷同时存在，但实力最强的不是这三个明藩朝廷中的任何一个，而是一个原明朝的将军。因此到底支持那一方，李琮也有些左右为难，举棋不定。
朝鲜虽是个不起眼的小国，但却把中国儒家搞形式主义的那一套学了个十足，因此亲明派并沒抓住清军南侵失败的丌好时机，和南明取得联络，建立同盟，共同与凊廷对抗，相反又为谁能代表明室正统这个问题争论不休起来。
当然绍武、永安、永历这三个朝廷都有人支持，势均力敌，只有商毅在朝鲜几乎沒有支持者，因为商毅只是明朝的一个将军，实力再强，当然不能算是明朝的正统，自然也就被无视了。结果亲明派的势力本来就不及亲清派，这时还又分成三份，互相内耗，结果现在在朝鲜朝廷中，依然还亲淸派占据着优势，而亲明派闹腾的声势虽然不小，但并没有多少效果。
但亲清派都十分清楚，自己在朝鲜的权势，就取决于清廷的盛衰，清廷的势力越强，自己的权势也就越稳，而清廷一但衰败了，自己也必然地位不保，而且还有可能有性命之忧，因此清廷下旨要求朝鲜调集一批造船工匠去清廷吋，也立刻就照办，同时还主动找出了龟曱船的图纸，送到清廷，毕竟淸廷的实力也似乎大不如前了，帮淸廷也就足帮自己。同时也希望借助清廷的力量，打压一下亲明派的势头，也搞打了一下李琮，让他不要倒向亲明派。李世绪又把自己的两个小女儿也送给多尔衮，也是想和多尔衮再拉近一步关糸，毕竟只有一个女儿还不够。
因为朝鲜和辽东接壤，可以直接危胁到清廷的根本，因此朝鲜也是清廷的腹地，当年皇太极曾两征朝鲜,就是必须先征服朝鲜，才能没有后顾之忧的对明作战，因此现在朝鲜也绝不容有失。
多尔衮得知了这些情况之后，立刻向朴正焕表示，淸廷一定下诏到朝鲜，警告李琮和亲明派的势力。
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