广东共产党高层的一致反对，使鲍罗廷也不能一意孤行，但鲍罗廷也不是轻易让步的人，在广东区委碰壁后，他转而说服上海的共产党中央，他在给陈独秀、彭述之的信里明确表示希望中共能让步，可以接受不参加这一届国民政府的要求。
中共中央在租界的一栋灰色小楼里召开临时会议讨论鲍罗廷的建议，陈独秀对参加政府更是不以为然，他毫不在意的嘲讽道：“中国社会主义革命的时机还没有到，这就急急忙忙的想当官了。”彭述之也赞同不参加：“仲甫说得对，政府的事就让国民党去搞，我们用不着去当那个官，真当了官恐怕很快就会脱离群众，变成官僚。”
生病刚好的张国焘感到有些不妥，这毕竟是鲍罗廷的一家之言，便委婉的说道：“仲甫同志，我们是不是征求一下广东区委的意见，他们到底是什么意思？”
“什么意思？还能有什么意思，我看他们是在广东过得太舒服了，广东的工人运动发展始终不如人意，农民协会呢，除了彭湃在海陆丰搞了几个，其他地方的农协还没有建立。那么好的条件，却…..，告诉他们踏踏实实的做点事情，不要老想着进政府。”陈独秀冷着脸说道。
“进不进政府我都没意见，我想谈谈五卅运动以来，我党暴露的一些问题，”蔡和森说着又用力咳嗽两声。陈独秀看他难受的样子，关切的说：“和森同志，你应该去医院检查一下，别太劳累了。”蔡和森摆摆手表示自己没事。
“五卅运动以来，我党组织在初期作了些工作，可是随着运动的深入，我党对运动的领导明显不足，党的干部整天瞎忙，没有抓住重点，现在我感到不是我们在领导运动，而是运动推着我们前进，这是我们工作的一大失误。”
蔡和森的话十分尖锐，会议中一阵沉默，李立三感到有些委屈，他是上海总工会委员长，是党派去领导五卅运动的。蔡和森这话无疑在指责他对运动领导不力。但蔡和森的批评他却无法反驳，总工会提出的十七条被总商会修改为十三条，但这十三条遭到各工会代表的反对，认为让步太大，而接受十三条的李立三更差点被轰下台。
“和森同志的批评是事实，可是我党领导五卅运动的主要阵地是上海总工会，总工会职员数百，下属工会就有一百多个，事务太多，干部太少，根本不够用。”
与李立三有同样感受的还有张国焘，张国焘是受中央委派负责指导上海工运的，他接过李立三的话说道：“立三同志的话没错，问题的根本还是我党力量太弱，整个上海我党能动用的力量全部投入到总工会中了，可尽管这样，还是捉襟见肘。”
“我没有指责立三同志和国焘同志的意思，我的看法与他们相同，我提出这个问题的目的是希望中央能重新考虑与国民党的合作方式，目前这种合作方式已经严重制约我党发展；仲甫刚才说道广东那么好的条件，可为什么没有发展起来呢？我认为还是受党内合作的影响，所以我郑重向中央提出修改目前的合作方式，由党内合作改为党外合作。”
蔡和森的话终于不可逆转的改变了会议的议题，对于党内合作从一开始中共高层就存在不同意意见，陈独秀、张国焘、蔡和森当初都反对党内合作，而主张与国民党建立联合统一战线，但当时共产国际派到中国的代表马林坚决要求采取这一形式，李大钊也支持马林的意见。观点分歧在第三次党代会上总爆发，张国焘、蔡和森、太祖与马林、瞿秋白、张太雷进行了长达两周的激烈辩论，在双方争执不下的时候，马林共产国际代表的身份起了重要作用，使中共最终同意采取党内合作的方式，张国焘甚至被排挤中央。
经过一年多的实践，现在党内合作的弊端已现端倪，党员数量与前两年相比没有大的变化，党的基层干部忙于建立国民党党部，忽视了共产党党组织的发展，上海是中共中央所在地，但上海的党组织却发展缓慢，一个五卅运动把上海党组织的全部人力投入进去都还不够。
陈独秀很是为难，蔡和森提出的问题他不是没考虑，可是要改变这个决策必须要得到共产国际的同意，中共中央无权对这样重大的决策进行修改，但共产国际是绝不可能同意修改这个决策的。
“党内合作是共产国际决定的，我们作为共产国际的下属组织必须遵守国际的决定，这是党的组织纪律。”陈独秀软弱的辩解道。
“我不同意和森同志的意见。”李立三说道：“从这次运动来看中国工人阶级的力量还很弱小，还不能领导中国革命，因此坚持国共合作是必要的，采取党内发展的方式也不是不可以，只是各地党员热衷于发展国民党党部，而忽视了我党的发展，是他们的指导思想错误，我认为应该由中央出面提醒他们要注意，在发展国民党的同时不能忽视我党的发展。”
“我也不同意和森同志的意见，国共合作之后广东的形势发展很好，我党的影响发展很快，况且，党内合作还有个目的是改造国民党，党外合作能达到这个目的吗？显然不能，我们不能被暂时的困难吓倒，要有信心，随着革命的发展，发展党组织，改造国民党，这两个目的都能办到。”瞿秋白也不赞成蔡和森的意见。
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